Caracterización molecular del micobioma intestinal mediante secuenciación ITS2–NGS en un caso de VIH con síndrome diarreico
DOI:
https://doi.org/10.65415/gc0sza03Palabras clave:
micobioma intestinal; ITS2; secuenciación de nueva generación; Saccharomyces; VIH.Resumen
El objetivo fue caracterizar la composición taxonómica y la diversidad fúngica de una muestra fecal de un paciente con VIH y síndrome diarreico mediante secuenciación de amplicones ITS2. Se realizó un estudio observacional descriptivo de caso único. El ADN extraído se amplificó mediante PCR con los cebadores ITS86F e ITS4; posteriormente, se prepararon bibliotecas y se efectuó la secuenciación en una plataforma Illumina MiSeq. La clasificación taxonómica original utilizó un clasificador bayesiano RDP y la base de datos UNITE. El análisis original reportó 36.597 lecturas, 147 especies y un índice de Shannon de 1,05. La categoría «sin clasificar a nivel de especie» agrupó 25.494 lecturas (69,66 %), mientras que Saccharomyces destacó entre las categorías taxonómicas identificadas. El perfil molecular mostró una resolución taxonómica incompleta.
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Referencias
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